Tại điểm 1.2.d.3, mục III, phần B Thông tư số 32/2007/TT-BTC ngày 9/4/2007 của Bộ Tài chính về thutế GTGT hướng dẫn: Hàng hoá, dịch vụ xuất khẩu phải thanh toán qua ngân hàng. Thanh toán qua ngân hàng là việc chuyển tiền từ tài khoản của bên nhập khẩu sang tài khoản mang tên bên xuất khẩu mở tại ngân hàng theo các hình thức thanh toán phù hợp với thoả thuận trong hợp đồng và quy định của ngân hàng. Chứng từ thanh toán tiền là giấy báo Có của ngân hàng bên xuất khẩu về số tiền đã nhận được từ tài khoản của ngân hàng bên nhập khẩu. Trường hợp tiền hàng xuất khẩu được thanh toán một  phần vào tài khoản mang tên cơ sở kinh doanh xuất khẩu, một phần vào tài khoản của cá nhân là người đại diện hợp pháp hoặc đại diện theo uỷ quyền của cơ sở kinh doanh thì doanh nghiệp xuất khẩu chỉ được khấu trừ thuế GTGT đầu vào của phần hàng xuất khẩu tương ứng với phần doanh thu được phía nước ngoài thanh toán vào tài khoản của cơ sở kinh doanh. Trường hợp thanh toán chậm trả, phải có thoả thuận ghi trong hợp đồng xuất khẩu, đến thời hạn thanh toán cơ sở kinh doanh phải có chứng từ thanh toán qua ngân hàng. Trường hợp uỷ thác xuất khẩu thì bên nhận uỷ thác xuất khẩu phải thanh toán với nước ngoài qua ngân hàng.

Căn cứ hướng dẫn trên, nếu trường hợp công ty uỷ thác cho một đơn vị khác xuất khẩu hàng hoá mà bên nhập khẩu thanh toán trực tiếp cho công ty qua ngân hàng thì phải được quy định rõ trong hợp đồng uỷ thác xuất khẩu giữa bên uỷ thác với bên nhận uỷ thác xuất khẩu và hợp đồng (hoặc phụ lục hợp đồng) xuất khẩu giữa bên nhận uỷ thác với bên nhập khẩu. Khi đó, cơ quan thuế mới có cơ sở để xem xét chấp nhận việc thanh toán này được coi là thanh toán qua ngân hàng. Bên uỷ thác xuất khẩu được kê khai khấu trừ thuế GTGT đầu vào của hàng hoá, dịch vụ mua vào phục vụ sản xuất hàng xuất khẩu nếu đảm bảo các điều kiện còn lại theo hướng dẫn tại điểm 1.2.c mục III, phần B Thông tư số 32/2007/TT-BTC nêu trên.

Nguồn:Vinanet