Nhằm thực hiện Nghị quyết của Chính phủ về những giải pháp cấp bách nhằm ngăn chặn suy giảm kinh tế, duy trì tăng trưởng kinh tế bảo đảm an ninh xã hội, ngày 13/01/2009, Bộ Tài chính ban hành Thông tư số 05/2009/TT-BTC về giãn thời gian ân hạn nộp thuế nhập khẩu, cải cách thủ tục thông quan hàng hoá xuất nhập khẩu và tỷ lệ phế liệu, phế phẩm không phải chịu thuế nhập khẩu trong gia công hàng hoá xuất khẩu, nhập nguyên liệu sản xuất hàng hóa xuất khẩu.

Thông tư mới quy định rõ việc giãn thời hạn nộp thuế nhập khẩu đối với vật tư, nguyên liệu nhập khẩu để sản xuất hàng xuất khẩu của một số ngành như đóng tàu, cơ khí, chăn nuôi, nuôi trồng thủy hải sản, ngọc trai, chế biến nông, lâm, thuỷ sản…; đơn giản hóa thủ tục và rút ngắn thời gian hoàn thuế đối với nguyên liệu nhập khẩu để sản xuất hàng xuất khẩu, kể cả khi doanh nghiệp chưa có chứng từ thanh toán qua ngân hàng; giao doanh nghiệp tự đăng ký và chịu trách nhiệm về định mức sử dụng nguyên liệu, vật tư sản xuất hàng xuất khẩu gồm cả phần phế liệu, phế phẩm nằm trong định mức không phải nộp thuế nhập khẩu.

Bên cạnh đó, Bộ Tài chính cũng thực hiện điều chỉnh tăng thuế xuất khẩu đối với một số tài nguyên khoáng sản, góp phần bảo đảm nguồn nguyên liệu cho sản xuất trong nước, đồng thời giảm thuế nhập khẩu đối với các mặt hàng nguyên liệu đầu vào của sản xuất để giúp giảm chi phí, nâng cao sức cạnh tranh.

Thông tư này có hiệu lực thi hành sau 45 ngày và áp dụng với các tờ khai hải quan hàng hoá xuất khẩu, nhập khẩu đăng ký với cơ quan hải quan từ ngày 01/01/2009. Cơ quan hải quan nơi có thẩm quyền thực hiện thủ tục hải quan, thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu và quản lý thuế đối với hàng hoá xuất khẩu nhập khẩu theo đúng quy định hiện hành và hướng dẫn tại Thông tư này. Trường hợp có vướng mắc, báo cáo cụ thể về Bộ Tài chính (Tổng cục Hải quan) để được hướng dẫn.