Nguyên nhân gây thiếu hụt nguồn tôm nguyên liệu do khi bước vào gieo cấy vụ lúa trên đất nuôi tôm, nhiều nông dân ở các địa phương vùng ngọt hóa như: Thới Bình, U Minh, Trần Văn Thời ngừng thả tôm giống xuống đồng đất, chỉ tập trung sản xuất lúa; triều cường dâng cao đột ngột vào trung tuần tháng 12 vừa qua đã làm ngập tràn khá lớn diện tích nuôi tôm ở các huyện Ngọc Hiển, Năm Căn, Đầm Dơi và Cái Nước, gây thất thoát gần như 100% lượng tôm nuôi của nông dân. Ngoài ra, phần lớn diện tích nuôi tôm ở những vùng nuôi tôm trọng điểm của Cà Mau vào cuối vụ thu hoạch, nông dân bước vào giai đoạn cải tạo ao đầm để thả giống nuôi vụ mới nên sản lượng tôm không còn nhiều. Một nguyên nhân nữa là nhiều nhà máy chế biến thủy sản xuất khẩu trong vùng đồng bằng sông Cửu Long đang thiếu nguyên liệu trầm trọng dẫn đến cạnh tranh trong thu mua, nên một lượng khá lớn tôm nguyên liệu chạy ra ngoài tỉnh di chuyển về những nhà máy này, gây thiếu hụt nguyên liệu cho chế biến xuất khẩu của Cà Mau.

Dự báo, tình hình thiếu hụt tôm nguyên liệu cho chế biến xuất khẩu ở Cà Mau sẽ kéo dài và diễn biến phức tạp trong những tháng đầu năm 2009. Khắc phục vấn đề này, các doanh nghiệp tập trung huy động 100% tôm nguyên liệu có tại tỉnh vào các nhà máy, đẩy mạnh mua nguyên liệu ngoài tỉnh và nhập khẩu nguyên liệu trên cơ sở tăng cường quản lý chất lượng, đảm bảo nguyên liệu tươi tốt và an toàn vệ sinh trước khi đưa vào chế biến, nhằm duy trì hoạt động chế biến, giữ chân công nhân. Cà Mau tiếp tục triển khai quy hoạch các vùng nuôi tôm trọng điểm trên cơ sở liên kết chặt chẽ giữa doanh nghiệp và nông dân, nhằm xây dựng ổn định và bền vững vùng nguyên liệu để chủ động sản xuất chế biến; nhân rộng, phát triển mạnh mô hình nuôi tôm quảng canh cải tiến năng suất cao, nuôi tôm công nghiệp và nuôi tôm chân trắng theo quy hoạch để tạo ra nguồn nguyên liệu dồi dào phục vụ chế biến xuất khẩu.