Ngày 23/11/2009, Cục Quản lý Chất lượng Nông lâm sản và Thủy sản (Nafiqad) nhận được thông tin về việc Cơ quan thẩm quyền quản lý an toàn thực phẩm Chilê ban hành qui định mới về điều kiện nhập khẩu (NK) thực phẩm thủy sản. Theo đó, tất cả các lô hàng thủy sản NK vào Chilê bắt buộc phải kèm theo Giấy chứng nhận xuất xứ do Cơ quan thẩm quyền quản lý về an toàn thực phẩm thủy sản nước xuất khẩu (XK) cấp theo mẫu qui định để phục vụ truy xuất nguồn gốc sản phẩm được sản xuất từ các cơ sở đảm bảo điều kiện vệ sinh an toàn thực phẩm (VSATTP) theo qui định của nước sở tại và quốc tế.

Tuy nhiên theo qui định của Việt Nam, Bộ Công Thương được Chính phủ giao nhiệm vụ là cơ quan tổ chức việc cấp Giấy chứng nhận xuất xứ hàng hoá XK. Hiện nay Bộ Công thương đang trực tiếp hoặc uỷ quyền cho Phòng Thương mại và Công nghiệp Việt Nam và một số tổ chức khác cấp Giấy chứng nhận xuất xứ cho hàng hoá XK. Trong khi đó, căn cứ Khoản 1, Điều 13 Nghị định 163/2004/NĐ-CP ngày 7/9/2004 của Chính phủ qui định chi tiết thi hành một số điều của Pháp lệnh VSATTP qui định “các sản phẩm thực phẩm XK phải đảm bảo VSATTP theo qui định của nước NK”.

Hiện nay, một số lô hàng thủy sản của doanh nghiệp đang bị ách tắc tại Chilê do không có Giấy chứng nhận xuất xứ trên. Vì vậy, ngày 27 tháng 11 năm 2009, bà Trần Bích Nga, Phó Cục trưởng Cục Quản lý Chất lượng Nông lâm sản và Thủy sản (Nafiqad) đã có công văn gửi Bộ trưởng Bộ NN&PTNT về việc cho phép chứng nhận xuất xứ lô hàng thủy sản XK vào Chilê.