Đáng lưu ý trong năm 2008, diện tích sản xuất hạt lai tiếp tục giảm và hiện chỉ còn khoảng 1.200ha, xấp xỉ 50% so với nhiều năm trước. Trong số này có đến 46/219 mẫu giống không đạt chuẩn. Khó khăn lớn nhất trong hoạt động sản xuất lúa lai hiện nay là do VN không chủ động được nguồn giống bố mẹ, phải phụ thuộc vào hạt giống bố mẹ nhập từ Trung Quốc.

Trong khi đó, giá thành sản xuất giống lúa lai trong nước lên tới 25.000đ/kg, cao hơn giá nhập ngoại và các DN không mặn mà với việc sản xuất lúa lai do tính rủi ro cao.

Để đẩy mạnh sản xuất hạt giống lúa lai, Cục Trồng trọt đề xuất tăng mức hỗ trợ thêm 1,5-2 lần cho các dự án khuyến nông về lúa lai, đồng thời xây dựng những vùng sản xuất lúa lai tập trung tại Quảng Nam, Thanh Hoá và Đắc Lắc.